剑桥晶体数据中心（CCDC）是一种晶体数据库，可以查询含有C-H 键的小分子晶体结构数据, 处理的分子原子总数在500以内。
BMRB是一个肽，蛋白质，核酸等的核磁共振数据存储库，可查询蛋白质和核酸结构NMR数据，包括指定的化学位移，J变换，弛豫率 以及从NMR研究中产生的化学信息（例如，氢交换速率和pKa值）。
中国国内的药物注册批准数据做的不错，历史数据较全，有审评结论
UniProt数据库是由瑞士生物信息学研究所多个研究团队共同建立并维护的一个免费蛋白质信息数据库，可查询蛋白质序列、物种信息等大量的信息。
