BMRB是一个肽，蛋白质，核酸等的核磁共振数据存储库，可查询蛋白质和核酸结构NMR数据，包括指定的化学位移，J变换，弛豫率 以及从NMR研究中产生的化学信息（例如，氢交换速率和pKa...
应用化学数据库是中科院长春应用化学研究所承担建设的综合科技信息数据库的重要组成部分，包含稀土萃取数据库，稀土物理化学性质数据库，碳-13 NMR数据库和化合物活性数据库。
SDBS是一个由日本国家先进工业科学技术研究所创办的综合性的有机化合物的光谱数据库系统，可查询质谱、1H-NMR谱、13C-NMR谱、FT-IR图谱、Raman谱和ESR谱7种光谱图的信息。
有机化合物数据库（OrganiccompoundsDatabase）是一个由哈佛大学弗吉尼亚研究所开发的免费数据库，可以搜索到的条目包括红外光谱、核磁共振谱、 质谱、紫外光谱等。
比较毒物基因组学数据库（CTD）是用设在北卡罗来纳州立大学（NCSU）的国立环境卫生科学研究所（NIEHS）提供的资金开发的一个免费数据库，可查询跨物种化学基因/蛋白质相互作用和化学-疾病关系以及基因-疾病关系的精确数据。
ChEMBL数据库是欧洲生物信息研究所（European Bioinformatics Institute，EBI）开发的一个免费在线数据库，可查询靶点或化合物的生物活性数据。
