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有机化合物数据库（OrganiccompoundsDatabase）是一个由哈佛大学弗吉尼亚研究所开发的免费数据库，可以搜索到的条目包括红外光谱、核磁共振谱、 质谱、紫外光谱等。
ChEMBL数据库是欧洲生物信息研究所（European Bioinformatics Institute，EBI）开发的一个免费在线数据库，可查询靶点或化合物的生物活性数据。
TOXNET是美国国立医学图书馆（NLM）建立的一个门户网站，可免费查询和检索化学品性质与结构、毒理学文献、毒理学信息、风险评估数据及有毒物质释放地图等信息。
