UniProt数据库是由瑞士生物信息学研究所多个研究团队共同建立并维护的一个免费蛋白质信息数据库，可查询蛋白质序列、物种信息等大量的信息。
有机化合物数据库（OrganiccompoundsDatabase）是一个由哈佛大学弗吉尼亚研究所开发的免费数据库，可以搜索到的条目包括红外光谱、核磁共振谱、 质谱、紫外光谱等。
粉末粒度模式数据库（PowBase）是一种恒定波长粉末图案的“最小数据库”，可查询波长、注释、VRML 3D视图等相关信息、
