应用化学数据库是中科院长春应用化学研究所承担建设的综合科技信息数据库的重要组成部分，包含稀土萃取数据库，稀土物理化学性质数据库，碳-13 NMR数据库和化合物活性数据库。
SDBS是一个由日本国家先进工业科学技术研究所创办的综合性的有机化合物的光谱数据库系统，可查询质谱、1H-NMR谱、13C-NMR谱、FT-IR图谱、Raman谱和ESR谱7种光谱图的信息。
ChEMBL数据库是欧洲生物信息研究所（European Bioinformatics Institute，EBI）开发的一个免费在线数据库，可查询靶点或化合物的生物活性数据。
