上海有机所化学数据库，包含多个数据库，如化合物结构数据库、核磁谱图数据库、质谱谱图数据库、红外谱图数据库、物化性质数据库等，注册后可免费使用。
ChEMBL数据库是欧洲生物信息研究所（European Bioinformatics Institute，EBI）开发的一个免费在线数据库，可查询靶点或化合物的生物活性数据。
默克索引（Merck Index）是由美国默克公司出版的记录化学药品、药物和生理性物质的综合性百科全书，可查询CAS号、化学式、分子量、结构式，熔点、沸点等化学信息。
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